Морфологический разбор

синагогою
имя существительное

Произношение
синаго́гою
Начальная формасинагога
Типнарицательное
Одушевленностьнеодушевлённое
Склонение1-e склонение
Родженский
Числоединственное
Падежтворительный

Склонение существительного «синагогою»

падежед. ч.мн. ч.
Им.синагогасинагоги
Рд.синагогисинагог
Дт.синагогесинагогам
Вн.синагогусинагоги
Тв.синагогойсинагогоюсинагогами
Пр.синагогесинагогах

Морфемный разбор (по составу) существительного «синагогою»

синагогою

синагого — корень,

ю — окончание.