Морфологический разбор

атомом
имя существительное

Произношение
а́томом
Начальная формаатом
Типнарицательное
Одушевленностьнеодушевлённое
Склонение2-e склонение
Родмужской
Числоединственное
Падежтворительный

Склонение существительного «атомом»

падежед. ч.мн. ч.
Им.атоматомы
Рд.атомаатомов
Дт.атомуатомам
Вн.атоматомы
Тв.атомоматомами
Пр.атомеатомах

Морфемный разбор (по составу) существительного «атомом»

атомом

атом — корень,

ом — окончание.