Морфологический разбор

гипоталамусом
имя существительное

Произношение
гипотала́мусом
Начальная формагипоталамус
Типнарицательное
Одушевленностьнеодушевлённое
Склонение2-e склонение
Родмужской
Числоединственное
Падежтворительный

Склонение существительного «гипоталамусом»

падежед. ч.мн. ч.
Им.гипоталамусгипоталамусы
Рд.гипоталамусагипоталамусов
Дт.гипоталамусугипоталамусам
Вн.гипоталамусгипоталамусы
Тв.гипоталамусомгипоталамусами
Пр.гипоталамусегипоталамусах

Морфемный разбор (по составу) существительного «гипоталамусом»

гипоталамусом

гипо — корень,

таламус — корень,

ом — окончание.