Морфологический разбор

фотобактерией
имя существительное

Произношение
фо̀тобактэ́рией
Начальная формафотобактерия
Типнарицательное
Одушевленностьодушевлённое
Склонение1-e склонение, на -ия
Родженский
Числоединственное
Падежтворительный

Склонение существительного «фотобактерией»

падежед. ч.мн. ч.
Им.фотобактерияфотобактерии
Рд.фотобактериифотобактерий
Дт.фотобактериифотобактериям
Вн.фотобактериюфотобактерий
Тв.фотобактериейфотобактериями
Пр.фотобактериифотобактериях

Морфемный разбор (по составу) существительного «фотобактерией»

фотобактерией

фото — корень,

бактери — корень,

ей — окончание.